Muzeum mieści się w budynku dawnych Koszar Bramy Chełmińskiej. Są one częścią XIX-wiecznej, pruskiej twierdzy Toruń.
Twierdza Toruń jest jednym z najlepiej zachowanych zespołów budowli obronnych w Europie. W muzeum prześledzimy kolejne etapy jej rozwoju, poznamy jej wpływ na życie miasta oraz przekonamy się, jak wyglądała codzienność stacjonujących tutaj żołnierzy. Zobaczymy też wiele cennych eksponatów, m.in. przewoźną wieżę pancerną.