Kościół św. Jana Chrzciciela to świątynia z długą i bogatą historią. Wzniesiona w XV w. w stylu gotyckim z fundacji biskupa poznańskiego Uriela Górki. Na przestrzeni wieków przeszła wiele przekształceń, które wpłynęły na jej wygląd i styl architektoniczny.
W XVIII w., za sprawą ówczesnego właściciela Czerniejewa, Władysława Radomickiego, kościół przeszedł gruntowną renowację, która obejmowała budowę nowej wieży. Te zmiany sprawiły, że obiekt niemal całkowicie stracił swój pierwotny gotycki charakter. Podczas kolejnych modyfikacji dobudowano dwie boczne kaplice i zakrystię, a także boczną nawę.
Wewnątrz znajduje się kilka cennych zabytków. Do najważniejszych należą XVI-wieczne drzwi do zakrystii, ozdobione herbem Górków, ołtarz główny z XVIII w. oraz dwa krucyfiksy z przełomu XVII i XVIII w. Ponadto w kościele znajdują się unikatowe przedmioty liturgiczne, np. XVII-wieczna kadzielnica. W podziemiach świątyni spoczywają szczątki zasłużonych mieszkańców Czerniejewa, w tym Jana Lipskiego, budowniczego miejscowego pałacu oraz jego rodziny.
