Historia kościoła i klasztoru pw. św. Franciszka z Asyżu jest bogata w zdarzenia i przemiany. W okresie reformacji świątynia przeszła pod kontrolę luteran, a po kasacie zakonów przez Fryderyka Wilhelma III została przekształcona na muzeum, a klasztor na szkołę. Dopiero po II wojnie światowej franciszkanie powrócili do Lwówka i podjęli się odbudowy swoich zabytkowych siedzib.
Jednonawowy kościół został rozbudowany na trójnawową budowlę z kamiennym korpusem i pięcioma przęsłami. Wnętrze świątyni ozdobione jest sklepieniami krzyżowo-żebrowymi i gwiaździstymi, a w murach znajdują się liczne gotyckie portale i okna. Wyposażenie wnętrza pochodzi głównie z XX i XXI w.
