Muzeum ma charakter regionalny. Można tu zobaczyć trzy wystawy stałe. Pierwsza prezentuje historię szkolnictwa na ziemi dobrzyńskiej od końca XIX wieku. Druga przedstawia średniowieczne dzieje miasta na podstawie wykopalisk prowadzonych w pobliskim Starorypinie. Trzecia opowiada o martyrologii mieszkańców Rypina i okolic podczas II wojny światowej (w budynku tym przez pewien czas funkcjonowało wówczas więzienie Gestapo).